ＬＤ版のために新規に作られたナディアのアニメーション。ちびキャラたちが繰り出すギャグ中心に話が進むものが多く、本編とは無縁のドタバタが展開される。現在ではＤＶＤ−ＢＯＸにも収録されているので、未見の方はそちらを。
各話共通のオープニングは「はじめ人間ギャートルズ」が元ネタ。
アフレコにナディア役の鷹森淑乃さんの出産が重なってしまったため、ナディアの出番がちょっと少ない。
【内容】
　・その１「１８８９・ナディアの世界の巻」
　・その２「これがネオ・アトランティスだ…の巻」
　・その３「万能潜水艦・ノーチラス号、26の秘密！の巻」
　・その４「ブルーウォーターの大ひみつ…の巻」
　・その５「ナディア、ミスコンに出場する（17.5話）の巻」
　・その６「ネオ・アトランティスへようこそ…の巻」
　・その７「ナディア超百科…の巻」
　・その８「夕やけジャンジャン（第52回）の巻」
　・その９「失われた時をもとめて…の巻」
　・その10「強さくらべ！Ｎ−ノーチラス対レッドノア…の巻」

本編の主人公にしてヒロイン。タルテソス王であったネモとその妃の間に生まれた長女で、ネオ（ビナシス）の妹。この世に三人しかいないアトランティス人の一人。双子座のＡ型。
2歳の時に生まれ故郷のタルテソスが滅んでしまい、サーカスに拾われて曲芸師（動物使い）「ジャングルの舞姫」として育てられる。14歳の時に自分の出自を求めてジャンと共に旅立つ。
いつも胸に下げているペンダントは、生い立ちの唯一の手がかりであるブルーウォーター。
【年齢】
　14歳（35話で15歳に）。1875年5月31日、アフリカ大陸タルテソス王国生まれ。
【容姿】
　紺色の髪。青い瞳。褐色の肌。ヘソ出しのファッション大好き。
　身長１５５センチ、体重４３キロ。
　バスト７９、ウエスト５８、ヒップ８３。
　足のサイズ２２．５センチ。指のサイズ８号。
【性格】
　アニメ界に衝撃を与えたワガママヒロイン。強情、意地っ張り、好き嫌いが激しい。人間不信の傾向がある反面、動物に対しては優しく、心を通わすことが出来る…とは本人談。幼い頃のトラウマによって菜食主義だが、卵は食べられる。
　自己をかえりみず自分を助けてくれるジャンのことは好き…なはずなのだが、なかなか素直になれない難しいお年頃。
【嗜好】
　好物はプレーンオムレツ、豆腐、うずら豆。
　嫌いなものは肉と魚（食べられない）。ピーマン、キノコ、たまねぎ（食べたくない）。
【特技】
　玉乗りと一輪車。水泳。運動一般に優れている。
【初期設定】
　ほとんど同じ。本当に人を憎んだこともなければ愛したこともない、不憫な女の子。

アトランティス人が南極大陸地下の大空洞に建設した基地。ノーチラス号の修理ドックや各種資材の採取基地が設置されている。
基地ではマンガン、ボーキサイト、黄鉄鉱、石油など豊富な資源が採掘される。

南極点の周囲に広がる巨大な大陸。１８８９年当時は人類未踏の地で（南極点に人類が到達したのは１９１１年）、その海岸線すらも判明していなかった。地下の大空洞にアトランティス人が南極基地を建築している。

ガーゴイルが＃０７で使用していた小型の銃。先端から針を高速で射出し、対象を殺傷するもの。

ネモたちが旧タルテソス王国地下から発掘した、航宙能力を持つ万能戦艦。アトランティス人の宇宙戦艦エクセリヲンを復活させたもの。レッドノアで大破したため放棄され、レッドノアともども宇宙に散った。
発進シークエンスは宇宙戦艦ヤマトのパロディで、主砲の音もヤマトの主砲ショックカノンと同一。
【外観】
　全長３３３．３メートル。基本重量３８０００トン。
【組織】
　ノーチラス号に同じ。
【攻撃兵装】
　・主砲　50センチ連装電子熱線砲２基
　・副砲　12.5センチ連装電子冷線砲４基
　・連装フェザー砲２０基
　・３連装フェザー砲１４基
　・ホーミング・レーザー発射口６０門（両舷に３０門ずつ）
　・航空爆雷射出口６門
　・艦首誘導弾射出口６門
　・６連装誘導弾射出口２門（船体側面）
　・艦載機射出口（６連）２門
　・搭載機数等は不明
【防御兵装】
　超電磁バリアー（復元が不完全なため最大稼動時間６０秒）
【最大速度】
　光速の９９％（ワープ時は超光速）
【エンジン】
　メイン…オルフェウス型大型縮退炉
　サブ…常温対消滅エンジン
【基準排水量】
　３８０００トン
【艦載艇】
　小型艇（メインブリッジ下部に収納。ブリッジ基部の左右にあるリボルバー式回転発射口から射出され、反重力推進で飛行する）

地球に生息する知的生命体。もともとはアトランティス人がしもべとして作り出した生命体。

ネオ・アトランティスが開発した万能土木機械にして死なない兵隊。通常は基地内の資材運搬用に用いられており、マハル基地にも数台配備されている。タンクに有線で連結された指揮車によってコントロールされる。ちなみにコックピットの操縦盤はチェスを模してある。デザインが微妙なのはやっぱり独自開発品だから。
通常の３倍の早さで動く中佐専用人間タンクもある。きっと色は赤いぞ！
【推進装置】
　レシプロエンジン

ガーゴイルが１３年前にクーデターによって立ち上げた組織でノーチラス号の宿敵。究極の目的はアトランティス帝国の復興とそれによる人類支配であり、当面の目標はバベルの塔の再建とレッドノアの復活。各国の政財界や軍部ともつながりがあり、世界通貨の８０分の１を動かす巨大な組織。形式的な指導者はネオ、実質的指導者はガーゴイル。３を基調とするアトランティスよりネオ（新しい）ということで４を基調としている（ロゴマークなどに顕著）。
こんな名前なのに、ネオ以外アトランティス人が一人もいないのは秘密。

ネオ・アトランティスの皇帝で（形式的）指導者。その正体はネモの息子でナディアの兄に当たるビナシス。ガーゴイルのクーデターの際に新たな皇帝として擁立されたが、王国崩壊時に肉体のほとんどを失う。その後、ネオ・アトランティスの科学技術により機械の体を与えられて生き続けていた。三相交流電源による電力稼動式。
ブルーウォーターを転移させることもできなかった１３年前のネオが、どうやってナディアを逃がしたのかは永遠の謎。

→ネオ・イコン・エピファネス

ガーゴイルの本名。
→ガーゴイル

ノーチラス号の船長。本名はエルシス＝ラ＝アルウォール。元タルテソス王で、この世に三人しかいないアトランティス人の一人。
意見の食い違いからガーゴイルと対立し、バベルの塔を復活させようとしたガーゴイルを止めるため、バベルの塔ごと国を滅ぼしてしまった過去を持つ。その罪をあがなうためノーチラス号を建造し、ガーゴイルとネオ・アトランティスを滅ぼすことだけを生きがいにしている。最期はナディアたちの命を守るため宇宙に散った。
ネモとはラテン語で「誰でもない」の意味。
【年齢】
　46歳。意外と知られていないが、エレクトラとの年齢差は、サンソン―マリーの年の差に匹敵する。
【容姿】
　黒い髪に黒い瞳。いつも帽子を目深にかぶり、表情を隠している。髪の毛が伸びるのが異常に早い。
【性格】
　海の漢。目的のためには手段を選ばない非情の人だったが、エレクトラやナディアに会って変わってきた。
【趣味】
　パイプオルガン。クルーにはおおむね好評。
【特技】
　海洋学と灼熱病の専門家。
【初期設定】
　非情、強情に見えるが実は心の大きな決断力に富んだ人物。優れた科学者で、優秀な戦士。

１．ネモをはじめとするクルーたちが誇る万能潜水艦。アトランティス人の宇宙船エルトリウムを改造したものだが、ブリッジと後甲板はネモたちが当時の技術で１３年かけて作っている。１８８８年６月２１日進水。乗組員は旧タルテソス王国の住民や、ネオ・アトランティスの被害者たちであり、人種や国籍を超えて固い絆で結ばれている。
【組織】
　船長　ネモ
　副長　エレクトラ
　メインクルー
　　探査測的長　エーコー＝ウィラン
　　機関長
　　操舵長
　　航海長
　　水準操作員（副操舵士）
　乗組員　５０〜６０名
【外観】
　全長約１５２メートル。複殻式。船長室、メインブロック、戦闘ブロックから成る。メインブロックは独立の推進力を有する。
　最後尾には後部大型格納庫。ハッチが３方向に開いて船外物を収容する。
【攻撃兵装】
　飛行爆雷（対空・対潜・対地）８基
　高速誘導弾（対潜）３２基
【防御兵装】
　ホム・ガード射出口１６基（両翼に８基ずつ）
　外殻（スペースチタニウム製。透明部は硬化テクタイト）
【最大速度】
　１０８ノット（約時速２００キロ）
【推進装置】
　常温対消滅エンジン（超硬ダイヤモンド・ファイバー製）
【推進】
　水流ジェット推進
【水中排水量】
　１２０００トン
【艦載艇】
　潜水球
　カッター（小型船）　数隻
【初期設定】
　艦首下部は一撃必殺の大型魚雷。パイロット・フィルム版では船体色はベージュだった。
２．レッドノアから脱出するために使用した、第二世代型惑星間航行用亜光速宇宙船。地球に戻ってから、日本海溝に沈められた。